"Une fois, ça va. Deux fois, trois fois, on se dit qu’il y a quelque chose qui se passe." Chaque matin, au laboratoire du Médipôle, Julien Colot examine ses antibiogrammes. Des tests qui permettent de déterminer quels antibiotiques peuvent encore agir sur une bactérie. Lorsqu’une résistance inhabituelle se répète, ou que des médecins lui signalent plusieurs échecs de traitement, l’alerte est donnée.

Pharmacien biologiste et microbiologiste au CHT, Julien Colot travaille depuis plus de dix ans sur ces résistances. Avec ses collègues et l’Institut Pasteur de Nouvelle-Calédonie, il a exploité la base de données du laboratoire sur la période 2005-2024. L’étude porte sur 111 022 isolats, c’est-à-dire des bactéries identifiées dans les prélèvements de 65 046 patients.

Commencé en 2017-2018, ce précieux travail vient d’être publié dans The Lancet Regional Health – Western Pacific [1], une revue scientifique internationale du groupe Lancet consacrée à la région. "Ça fait plaisir quand ça sort, d’être reconnu", se réjouit Julien Colot. La publication offre aussi une visibilité rare au pays, dans une région Pacifique où les données sur l’antibiorésistance restent peu nombreuses.

Pas de hausse générale

Les résultats de l’étude ne montrent pas de hausse continue. Sur vingt ans, 11 % des bactéries analysées sont considérées comme multirésistantes, car elles résistent à des antibiotiques appartenant à au moins trois familles différentes. Cette proportion, calculée sur les bactéries étudiées, et non sur les patients, a culminé à 14,5 % en 2020, avant de diminuer à partir de 2021.

Mais ces données ne donnent qu’une vue partielle de la situation. Si le CHT réalise plus de la moitié des antibiogrammes du pays, il reçoit surtout des patients du Sud ainsi que des cas graves transférés au Médipôle. Les résistances peuvent donc y être surreprésentées et les résultats ne peuvent pas être extrapolés à l’ensemble de la population calédonienne.

Des alertes suivies d’effets

Le laboratoire ne se contente pas de suivre des courbes. Lorsqu’une résistance apparaît, il alerte les médecins et se coordonne avec l’Institut Pasteur pour étudier la bactérie. Les résultats peuvent ensuite conduire à changer de traitement, à revoir les recommandations, ou à renforcer les mesures d’hygiène. Si l’étude ne permet pas d’attribuer les baisses au seul travail du laboratoire, elle met en lumière comment cette surveillance débouche sur des décisions concrètes.

L’exemple le plus parlant est probablement celui du staphylocoque doré. En 2018, près de 42 % des bactéries analysées résistaient à la méticilline, ce qui les rendait plus difficiles à traiter. Les recherches menées sur la souche en circulation ont également mis en évidence sa résistance à l’acide fusidique, la molécule de la Fucidine, un médicament alors très utilisés par les Calédoniens contre les infections de la peau.

En février 2021, le gouvernement, alerté, a suspendu les autorisations de mise sur le marché des médicaments cutanés à base d’acide fusidique. Cette décision, couplée à l’évolution des prescriptions et à l’information des médecins, a conduit au recul de la souche résistante. Selon la courbe 2025 présentée par Julien Colot, la proportion de staphylocoques dorés résistants à la méticilline est désormais tombée à 8 %. Mais "ce n’est pas pour autant qu’il faut relâcher la vigilance", prévient le microbiologiste.

Le suivi a également permis de mesurer une chute de 97 % de la résistance d’Acinetobacter baumannii (une bactérie pouvant provoquer de graves infections lors d’une hospitalisation), à des antibiotiques utilisés en dernier recours. Le gonocoque est la bactérie responsable de la gonorrhée, une infection sexuellement transmissible. En Nouvelle-Calédonie, cette maladie a longtemps été traitée avec de la pénicilline G. Mais le laboratoire a vu apparaître des résistances, tandis que les médecins constataient des échecs de traitement. Les recommandations ont donc été modifiées. Grâce à cette surveillance, les médecins ont pu abandonner les antibiotiques devenus moins efficaces au profit de traitements mieux adaptés aux bactéries qui circulent localement.

Des résultats qui prennent corps dans les ordonnances

Cette surveillance continue alimente l’Antibioguide NC [2], en libre accès et dont Les Nouvelles présentaient le lancement en novembre 2024 [3]. Sur son téléphone ou son ordinateur, un médecin peut sélectionner une infection et son niveau de gravité, l’âge du patient et évaluer si un antibiotique est nécessaire, lequel choisir, à quelle dose et pendant combien de temps.

Chapeauté par la direction des affaires sanitaires et sociales (Dass), le guide est régulièrement actualisé par des infectiologues, des biologistes et des pharmaciens en fonction des résistances observées. Car les bactéries présentes à Nouméa ne réagissent pas toujours comme celles rencontrées à Paris ou à Bangkok. L’objectif est d’éviter d’utiliser un traitement très puissant lorsqu’un antibiotique plus ciblé suffit. "On n’utilise pas un bazooka pour tuer une mouche", illustre Julien Collot.

La Dass indique toutefois qu’il n’existe pas encore de politique publique territoriale formalisée sur l’antibiorésistance. Le dispositif repose donc sur la collaboration entre les établissements de santé, les prescripteurs, le CHT, l’Institut Pasteur et les services du gouvernement.

Le modèle commence même à intéresser au-delà du pays. Selon Julien Colot, des interlocuteurs à Fidji et en Polynésie ont demandé à s’inspirer de l’interface pour développer leur propre guide, adapté aux résistances observées chez eux.

Quant aux équipes du CHT, elles sont déjà mobilisées sur un autre signal. Des souches résistantes d’Haemophilus influenzae, une bactérie fréquemment présente dans le nez et la gorge, ont été repérées en laboratoire. Elles sont désormais séquencées à l’Institut Pasteur afin d’identifier les gènes à l’origine de cette résistance.